RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	VMP1	Q96GC9	406 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF681	Q96N22	645 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	UCN2	Q96RP3	112 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	RASL10B	Q96S79	203 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	MKS1	Q9NXB0	559 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	LRFN1	Q9P244	771 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CCR3-208	ENST00000545097		A0A088AWK7	358 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	DYTN	A2CJ06	578 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CLDN4	O14493	209 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	GPR75	O95800	540 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	IL3	P08700	152 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ICAM2	P13598	275 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CLCN2	P51788	898 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	DNAJB13	P59910	316 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	RNF4	P78317	190 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	LCA5	Q86VQ0	697 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	SLC5A8	Q8N695	610 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	VPS50	Q96JG6	964 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	DGAT2	Q96PD7	388 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC77	Q9BR77	488 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	PROK2	Q9HC23	129 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	PHF11	Q9UIL8	331 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	APC	P25054	2843 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	BLACE	A4D250	179 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	C17orf51	A8MQB3	221 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ITM2A	O43736	263 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	PCDH7	O60245	1069 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	NME2P1	O60361	137 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	VPS4B	O75351	444 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	SLC25A12	O75746	678 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	SP1	P08047	785 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CCL3	P10147	92 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	TNNI3	P19429	210 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	NME2	P22392	152 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	HMOX2	P30519	316 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	HLCS	P50747	726 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	MAPK12	P53778	367 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	PKNOX1	P55347	436 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	SLC37A1	P57057	533 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ASPH	Q12797	758 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	NNAT	Q16517	81 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC153	Q494R4	210 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	LIPM	Q5VYY2	423 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097		Q6ZSR9	355 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC63	Q8NA47	563 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	AGR3	Q8TD06	166 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	NR4A3	Q92570	626 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	EGLN2	Q96KS0	407 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	C3orf30	Q96M34	536 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CCR3-208	ENST00000545097	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		7.51	□□□□□ -1.21

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