RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DCLK2	Q8N568	766 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	STPG4	Q8N801	248 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RNF149	Q8NC42	400 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ST7L	Q8TDW4	575 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FAM3C	Q92520	227 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FGF14	Q92915	247 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	AP2M1	Q96CW1	435 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CABS1	Q96KC9	395 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CEP170P1	Q96L14	293 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CUEDC2	Q9H467	287 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MYH11	P35749	1972 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ILVBL	A1L0T0	632 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089		E5RGE8	158 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MSH4	O15457	936 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DDHD2	O94830	711 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SLC16A8	O95907	504 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PNP	P00491	289 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	EDN1	P05305	212 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SBK2	P0C263	348 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF806	P0C7X5	589 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TDGF1	P13385	188 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	P4HA1	P13674	534 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SERPINB6	P35237	376 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CLDN15	P56746	228 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PHEX	P78562	749 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ARF5	P84085	180 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CDR2	Q01850	454 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CETN1	Q12798	172 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ABR	Q12979	859 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RPA4	Q13156	261 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	EMC2	Q15006	297 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MAPK11	Q15759	364 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	IFI44L	Q53G44	452 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	WDR38	Q5JTN6	314 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TPGS2	Q68CL5	300 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FBXL16	Q8N461	479 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SMARCD2	Q92925	531 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SNX21	Q969T3	373 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MAP3K3	Q99759	626 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ATG101	Q9BSB4	218 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZFP57	Q9NU63	452 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PI4KA	P42356	2102 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	USP24	Q9UPU5	2620 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	EML5	Q05BV3	1969 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	THADA	Q6YHU6	1953 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	C17orf105	B2RV13	164 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	P2RY10	O00398	339 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PRRG1	O14668	218 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CPLX1	O14810	134 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CHAD	O15335	359 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CCL16	O15467	120 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	LMX1B	O60663	402 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RTN2	O75298	545 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DFFB	O76075	338 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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