RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 TRABD2AQ86V40 505 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 TM4SF18Q96CE8 201 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ACPTQ9BZG2 426 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ERVK-19Q9WJR5 959 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PLLPQ9Y342 182 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 OR6B1O95007 311 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 STSP08842 583 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 CHN1P15882 459 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SOX3P41225 446 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 XKP51811 444 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 LIPMQ5VYY2 423 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 IL20RBQ6UXL0 311 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 MDGA2Q7Z553 956 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 BANPQ8N9N5 519 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 POGLUT1Q8NBL1 392 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 APOPT1Q96IL0 206 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNA7Q96RP8 456 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 FAIM2Q9BWQ8 316 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PARD6BQ9BYG5 372 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 MCM8Q9UJA3 840 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 CES1P1Q9UKY3 287 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 WIPF3A6NGB9 483 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SPIN4Q56A73 249 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PIGGQ5H8A4 983 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC48A1Q6P1K1 146 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 OPN5Q6U736 354 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 RNF111Q6ZNA4 994 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SULF2Q8IWU5 870 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 MREGQ8N565 214 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 DOK4Q8TEW6 326 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 GPR137Q96N19 417 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 CXorf21Q9HAI6 301 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PSME2Q9UL46 239 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 OR6C76A6NM76 312 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PEX1O43933 1283 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 LDLRP01130 860 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 CPMP14384 443 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PORP16435 677 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 MEOX1P50221 254 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 FOXA1P55317 472 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 HMGCS1Q01581 520 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 RBPJQ06330 500 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC29A4Q7RTT9 530 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SIAH3Q8IW03 269 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A1B0GUH1 482 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A1W2PS29 197 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 NPIPA5E9PKD4 350 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRTM2O43300 516 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 CRCPO75575 148 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 WISP2O76076 250 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 RNF224P0DH78 156 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF24P17028 368 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC37A1P57057 533 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ASPHQ12797 758 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 GALNT12Q8IXK2 581 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC15A4Q8N697 577 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PSD4Q8NDX1 1056 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC22A8Q8TCC7 542 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 APIPQ96GX9 242 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SGCZQ96LD1 299 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDH7O60245 1069 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM13O60858 407 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 RAE1P78406 368 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 PCLAFQ15004 111 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 C6orf163Q5TEZ5 329 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 GALNT18Q6P9A2 607 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 SCIMPQ6UWF3 145 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 RTL4Q6ZR62 310 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 GOLM1Q8NBJ4 401 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 SIRT5Q9NXA8 310 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 RAB21Q9UL25 225 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 CLPSP04118 112 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 NT5EP21589 574 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 PER3P56645 1201 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 FUT7Q11130 342 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF750Q32MQ0 723 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 RNFT1Q5M7Z0 435 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM46Q7Z4K8 759 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-217ENST00000527644 MMP21Q8N119 569 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms