RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516016.1

RN7SKP19-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP19, Length 252 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP19-201ENST00000516016 UNC5CLQ8IV45 518 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ANKRD42Q8N9B4 389 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RAB3CQ96E17 227 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PELI1Q96FA3 418 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 C16orf58Q96GQ5 468 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TSNARE1Q96NA8 513 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MUS81Q96NY9 551 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IL4I1Q96RQ9 567 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MBOAT4Q96T53 435 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 DPH7Q9BTV6 452 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 WWP1Q9H0M0 922 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 C5orf66Q9H5L9 145 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PTGES2Q9H7Z7 377 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MED17Q9NVC6 651 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TAS2R16Q9NYV7 291 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CACNA1DQ01668 2161 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRAV40A0A0B4J280 105 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MACROD2A1Z1Q3 448 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC17A2O00624 439 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CLDN4O14493 209 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR6A2O95222 327 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LYNP07948 512 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CT45A10P0DMU9 189 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ADRB3P13945 408 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PVRP15151 417 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CYP11B2P19099 503 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 EPORP19235 508 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 HTR1EP28566 365 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 HADHAP40939 763 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TFPI2P48307 235 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CSNK1DP48730 415 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 FHITP49789 147 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCR6P51684 374 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CACNG7P62955 275 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IL10RBQ08334 325 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LCP2Q13094 533 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PRSS8Q16651 343 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 EOGTQ5NDL2 527 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TSPAN14Q8NG11 270 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC26A7Q8TE54 656 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 FRZBQ92765 325 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC35C1Q96A29 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TMEM101Q96IK0 257 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 C9orf85Q96MD7 179 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CNPY3Q9BT09 278 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 POLR3GLQ9BT43 218 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 APOL6Q9BWW8 343 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NACAP1Q9BZK3 213 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CARD9Q9H257 536 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SPNS1Q9H2V7 528 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 APMAPQ9HDC9 416 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TMOD3Q9NYL9 352 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GDE1Q9NZC3 331 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SEC14L4Q9UDX3 406 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF225Q9UK10 706 aa0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PLA2R1Q13018 1463 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TMEM150CB9EJG8 249 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PHGR1C9JFL3 82 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 BET1O15155 118 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NUDT14O95848 222 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 INSP01308 110 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PRB1P04280 392 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MMP10P09238 476 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SSTR1P30872 391 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC7A2P52569 658 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ACTA2P62736 377 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ACTC1P68032 377 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 BCL2L1Q07817 233 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 KRT32Q14532 448 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 KCTD2Q14681 263 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PTPRCAPQ14761 206 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM83EQ2M2I3 478 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MFSD7Q6UXD7 560 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OTOAQ7RTW8 1153 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NEGR1Q7Z3B1 354 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CACUL1Q86Y37 369 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TTC30BQ8N4P2 665 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TTC39CQ8N584 583 aa0.04□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms