RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.3□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ANKMY1Q9P2S6 941 aa3.3□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.3□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.3□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.3□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 A0A087WZ39 114 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 LRCH4O75427 683 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SYNGR4O95473 234 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SEC24AO95486 1093 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 AK1P00568 194 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 IGHDP01880 384 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 LYNP07948 512 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TSPY4P0CV99 314 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TSPY10P0CW01 314 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 KRT3P12035 628 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 PRKACGP22612 351 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 DNAJB1P25685 340 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 HLA-FP30511 346 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SOX3P41225 446 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 MAGEA4P43358 317 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TNFRSF4P43489 277 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CCL11P51671 97 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 XGP55808 180 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TMEM50BP56557 158 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 GABPAQ06546 454 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 DPYSQ14117 519 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 Q6ZVH6 145 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 MCM10Q7L590 875 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SYVN1Q86TM6 617 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 KCNMB4Q86W47 210 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ELMOD1Q8N336 334 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CCDC185Q8N715 623 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 IPMKQ8NFU5 416 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 RAB39BQ96DA2 213 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 C2orf48Q96LS8 159 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 GPR137Q96N19 417 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 PCDHB18PQ96TA0 734 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SSX3Q99909 188 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CCSER1Q9C0I3 900 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 GANQ9H2C0 597 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 PALMDQ9NP74 551 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TBK1Q9UHD2 729 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.29□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 NEDD4P46934 1319 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ASB14A6NK59 587 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SIGLEC5O15389 551 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 NME2P1O60361 137 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 FOLR2P14207 255 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 GP9P14770 177 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 GPX3P22352 226 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 AADACP22760 399 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CCND2P30279 289 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 OR3A2P47893 321 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TRPC1P48995 793 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SSTP61278 116 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 GRB14Q14449 540 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 C3AR1Q16581 482 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 TEX35Q5T0J7 233 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 RTL6Q6ICC9 239 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 LEKR1Q6ZMV7 388 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 AMZ2Q86W34 360 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 WDR49Q8IV35 697 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CLTC-208ENST00000496076 PHYHIPQ92561 330 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms