RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PNV4 684 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 LRIT2A6NDA9 550 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CDC7O00311 574 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GNB5O14775 395 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 HS3ST1O14792 307 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 DLX3O60479 287 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ABCB7O75027 752 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ETHE1O95571 254 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CRHP06850 196 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 F7P08709 466 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CPN1P15169 458 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GNAZP19086 355 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 UGT2B10P36537 528 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SLC1A2P43004 574 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SLCO1A2P46721 670 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PCYT1AP49585 367 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 NAGLUP54802 743 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 NRG3P56975 720 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CDK16Q00536 496 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SNX1Q13596 522 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SETDB1Q15047 1291 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR2A2Q6IF42 318 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 AAGABQ6PD74 315 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 LYPD8Q6UX82 237 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CCDC170Q8IYT3 715 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SPC24Q8NBT2 197 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR2L5Q8NG80 312 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD7Q92527 254 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CAVIN3Q969G5 261 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 FBXL20Q96IG2 436 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KCNK17Q96T54 332 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 EGFL8Q99944 293 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 UBQLN3Q9H347 655 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 LYRM4Q9HD34 91 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SNX15Q9NRS6 342 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 MED16Q9Y2X0 877 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 NCKAP5O14513 1909 aa5.6□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 MED12Q93074 2177 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CTAGE15A4D2H0 777 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR6C76A6NM76 312 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 PLOD2O00469 737 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 OR10H2O60403 315 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CLEC3AO75596 197 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TNFSF13O75888 250 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SRD5A1P18405 259 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TPSB2P20231 275 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CPN2P22792 545 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CCKARP32238 428 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 STT3AP46977 705 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 KCNC1P48547 511 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 CASP9P55211 416 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 FBXW4P57775 412 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 IL2P60568 153 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 HERVK_113P63132 956 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ERVK-8P63133 956 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SIRPAP78324 504 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 BIKQ13323 160 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 FGFBP1Q14512 234 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 TPSAB1Q15661 275 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.59□□□□□ -1.51
CBX1-205ENST00000495350 C6orf163Q5TEZ5 329 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms