RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494607.5

PQLC1-208, Transcript of PQ loop repeat containing 1, human

TSL 3

Gene PQLC1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC1-208	ENST00000494607	MFRP	Q9BY79	579 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	THAP1	Q9NVV9	213 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	HAO1	Q9UJM8	370 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	OR5H15	A6NDH6	313 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ATP1B1	P05026	303 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	DDC	P20711	480 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	CD97	P48960	835 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	KIAA0040	Q15053	153 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	NADK2	Q4G0N4	442 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF605	Q86T29	641 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	BEST3	Q8N1M1	668 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SORT1	Q99523	831 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	HEY2	Q9UBP5	337 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	GABRR3	A8MPY1	467 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC28A2	O43868	658 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SASH3	O75995	380 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	WDPCP	O95876	746 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	IGKV3-11	P04433	115 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ASMT	P46597	345 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	TNFSF10	P50591	281 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	MLF1	P58340	268 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ERVK-8	P63133	956 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	C2orf80	Q0P641	193 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	MMP21	Q8N119	569 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	AMER2	Q8N7J2	671 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF721	Q8TF20	911 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	UCN3	Q969E3	161 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	14.97	□□□□□ -0.01	6e-10	■■■□□ 14.6
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	OR6C76	A6NM76	312 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	KLF11	O14901	512 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	PEX11A	O75192	247 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ATP6AP2	O75787	350 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	NT5E	P21589	574 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	RNF4	P78317	190 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SMU1	Q2TAY7	513 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	NPAS2	Q99743	824 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PQLC1-208	ENST00000494607	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607		A0A1W2PS29	197 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	TTLL8	A6PVC2	850 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	VPS4B	O75351	444 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	SDC1	P18827	310 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	PPP2R2A	P63151	447 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	TUBA3C	Q13748	450 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	NUBPL	Q8TB37	319 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PQLC1-208	ENST00000494607	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02

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