RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ASPDHA6ND91 283 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 A8MT66 165 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF223E7ERA6 249 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FGF17O60258 216 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 LDB3O75112 727 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ITGA10O75578 1167 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CTAG2O75638 210 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC25A12O75746 678 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NEURL1O76050 574 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFAND5O76080 213 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SEMA3DO95025 777 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MLYCDO95822 493 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OTCP00480 354 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TPOP07202 933 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SP1P08047 785 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS17P08708 135 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SBK3P0C264 359 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 COX7A2P14406 83 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TAC1P20366 129 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 BSGP35613 385 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CYB561P49447 251 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 HLCSP50747 726 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR143P51810 404 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NEK2P51955 445 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 DLX5P56178 289 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 HSF1Q00613 529 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFRSF17Q02223 184 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TRAF3Q13114 568 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SLAMF1Q13291 335 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CUL3Q13618 768 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC29A2Q14542 456 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX35Q5T0J7 233 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FRG2Q64ET8 278 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR180Q86V85 440 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 LCA5Q86VQ0 697 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MORN4Q8NDC4 146 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 AGAP11Q8TF27 550 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TANKQ92844 425 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FRMD6Q96NE9 622 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CDK15Q96Q40 435 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FRG2BQ96QU4 278 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SERPINI1Q99574 410 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 HES7Q9BYE0 225 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 HIVEP2P31629 2446 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C17orf105B2RV13 164 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 DYRK3O43781 588 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TMPRSS11DO60235 418 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NME2P1O60361 137 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ETHE1O95571 254 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GSTA1P08263 222 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NR2F6P10588 404 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TNNI3P19429 210 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NME2P22392 152 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MSX1P28360 303 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 STT3AP46977 705 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SSR4P51571 173 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms