RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SERPINB4P48594 390 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 NUP107P57740 925 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 RNF4P78317 190 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PMPCAQ10713 525 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 STX4Q12846 297 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MORN4Q8NDC4 146 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 KCNC2Q96PR1 638 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OR51B5Q9H339 312 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 WASHC1A8K0Z3 465 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 HRKO00198 91 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 FGF17O60258 216 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SUPT3HO75486 399 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CCL3P10147 92 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MTHFD2P13995 350 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MAGEA5P43359 124 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 DNASE1L1P49184 302 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 GYS2P54840 703 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TFF3Q07654 80 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PCLAFQ15004 111 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 GXYLT1Q4G148 440 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 HHATQ5VTY9 493 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 EID3Q8N140 333 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OR7G3Q8NG95 312 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 RDH11Q8TC12 318 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ZNF721Q8TF20 911 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 RND1Q92730 232 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 C14orf79Q96F83 325 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LYRM4Q9HD34 91 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LRRC14BA6NHZ5 514 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 A8MT66 165 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 DLX3O60479 287 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TOXO94900 526 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 BPGMP07738 259 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MYL2P10916 166 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CPA3P15088 417 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 IGFBP2P18065 325 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CNR1P21554 472 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CPN2P22792 545 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ALDH3A1P30838 453 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PIGAP37287 484 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CASP2P42575 452 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SSR2P43308 183 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TGM3Q08188 693 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 FOXO1Q12778 655 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ASPHQ12797 758 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LAPTM5Q13571 262 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 E2F2Q14209 437 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TBCCQ15814 346 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 C18orf63Q68DL7 685 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MED27Q6P2C8 311 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 RTL4Q6ZR62 310 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CDH24Q86UP0 819 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CCDC63Q8NA47 563 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MECRQ9BV79 373 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MID2Q9UJV3 735 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MED13LQ71F56 2210 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 WDR91A4D1P6 747 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 K7EPI3 171 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms