RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 TNFRSF17Q02223 184 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 DEFB134Q4QY38 66 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM64Q6YI46 380 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 USP53Q70EK8 1073 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 RNF130Q86XS8 419 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CARFQ8N187 725 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MAL2Q969L2 176 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 PYURFQ96I23 114 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF597Q96LX8 424 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 BTBD9Q96Q07 612 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CSF3RQ99062 836 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CD180Q99467 661 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 AURKCQ9UQB9 309 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 TRIOO75962 3097 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 FAM149AA5PLN7 773 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 TLCD2A6NGC4 264 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 URADA6NGE7 173 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CLOCKO15516 846 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 B3GALT2O43825 422 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 KRT75O95678 551 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 SERPINA1P01009 418 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 NTRK1P04629 796 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 IFI6P09912 130 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 FCGR1AP12314 374 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 GNSP15586 552 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 PNLIPP16233 465 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CKMT2P17540 419 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CDH3P22223 829 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CSF2RBP32927 897 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CNR2P34972 360 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 HOXD12P35452 270 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MAGEA8P43361 318 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MAN2A2P49641 1150 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 OR1D5P58170 312 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 HLA-BQ31612 363 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 IRGCQ6NXR0 463 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MED25Q71SY5 747 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ABHD13Q7L211 337 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CA13Q8N1Q1 262 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 SFXN5Q8TD22 340 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 GIMAP5Q96F15 307 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 C7orf34Q96L11 122 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 PDP2Q9P2J9 529 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 PHF11Q9UIL8 331 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA6-210ENST00000475302 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms