RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 CCDC14Q49A88 953 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TCTE1Q5JU00 501 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 NPNTQ6UXI9 565 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SRLQ86TD4 932 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 HOOK3Q86VS8 718 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PAF1Q8N7H5 531 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 LINC01006Q8NI28 216 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 JADE3Q92613 823 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 STARD4Q96DR4 205 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CSF3RQ99062 836 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 KRT12Q99456 494 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CPLX1O14810 134 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC43A1O75387 559 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 GCNT3O95395 438 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 LHBP01229 141 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CRYBA1P05813 215 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CD1AP06126 327 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CRHP06850 196 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CNR1P21554 472 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 GATA3P23771 443 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PRPHP41219 470 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 GRIA3P42263 894 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CASP4P49662 377 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 DYRK1AQ13627 763 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 RCAN2Q14206 197 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CARTPTQ16568 116 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TRIM73Q86UV7 250 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TMEM156Q8N614 296 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 LCN9Q8WX39 176 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ISOC1Q96CN7 298 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SCRN2Q96FV2 425 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PGM2Q96G03 612 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 FBXL20Q96IG2 436 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CYTH2Q99418 400 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PLIN2Q99541 437 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 OR10A4Q9H209 315 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 MKS1Q9NXB0 559 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PSMD13Q9UNM6 376 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.54□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 A0A0J9YY10 115 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ANKRD62A6NC57 917 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SHISA9B4DS77 424 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 LY6G6CO95867 125 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 IGLL1P15814 213 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 UGT2B7P16662 529 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 GPD1P21695 349 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PRCPP42785 496 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 RGRP47804 291 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 AGTR2P50052 363 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CDH11P55287 796 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC26A5P58743 744 aa4.53□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PIGFQ07326 219 aa4.53□□□□□ -1.68
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