RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	SMIM23	A6NLE4	172 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	MANBA	O00462	879 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	PRRG2	O14669	202 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM13	O60858	407 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ULK1	O75385	1050 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	WDPCP	O95876	746 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	PDYN	P01213	254 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FGF4	P08620	206 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CPN2	P22792	545 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	PRPH2	P23942	346 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	HMOX2	P30519	316 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	KIR3DL1	P43629	444 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	STT3A	P46977	705 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	NEK2	P51955	445 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	NAGLU	P54802	743 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP10-9	P60411	292 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	STX4	Q12846	297 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SPIN4	Q56A73	249 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF766	Q5HY98	468 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ACER2	Q5QJU3	275 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF175	Q8N4F7	328 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM47B	Q8NA70	645 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	VMP1	Q96GC9	406 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR137	Q96N19	417 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CSF3R	Q99062	836 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF559	Q9BR84	538 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNK13	Q9HB14	408 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	MCM8	Q9UJA3	840 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PR48	441 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	C1orf226	A1L170	272 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	C19orf84	I3L1E1	186 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TMPRSS11D	O60235	418 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	NPHS1	O60500	1241 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	EED	O75530	441 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR75	O95800	540 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	F10	P00742	488 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	NR2F6	P10588	404 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	UROS	P10746	265 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	COX7A2	P14406	83 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ETV4	P43268	484 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CLCN2	P51788	898 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC18A1	P54219	525 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	PLIN5	Q00G26	463 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FOLH1	Q04609	750 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT71	Q3SY84	523 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CES4A	Q5XG92	561 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP21	Q8N119	569 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	GHDC	Q8N2G8	530 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXL20	Q96IG2	436 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ART5	Q96L15	291 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	STMN3	Q9NZ72	180 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245		E9PLN8	166 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	TM9SF1	O15321	606 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	BIRC5	O15392	142 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	DYRK3	O43781	588 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	FGF17	O60258	216 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	MYO1D	O94832	1006 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TTLL3-223	ENST00000466245	AIFM1	O95831	613 aa		9.34	□□□□□ -0.91

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