RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVK-19Q9WJR5 959 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHEK2O96017 543 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UROSP10746 265 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHN1P15882 459 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NT5EP21589 574 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBPJQ06330 500 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCLAFQ15004 111 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC48A1Q6P1K1 146 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OPN5Q6U736 354 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL20RBQ6UXL0 311 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUBPLQ8TB37 319 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC22A8Q8TCC7 542 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UCN3Q969E3 161 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLHL29Q96CT2 875 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GAL3ST4Q96RP7 486 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RASL10BQ96S79 203 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEC14L3Q9UDX4 400 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OSGIN2Q9Y236 505 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR6C76A6NM76 312 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGKV3-11P04433 115 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPMP14384 443 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXA1P55317 472 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOMEZQ8IX15 550 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POGLUT1Q8NBL1 392 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DOK4Q8TEW6 326 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 APIPQ96GX9 242 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CENPHQ9H3R5 247 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CXorf21Q9HAI6 301 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC5A6Q9Y289 635 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HECTD1Q9ULT8 2610 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SVILO95425 2214 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SERTM1A2A2V5 107 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASPDHA6ND91 283 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HRKO00198 91 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR6B1O95007 311 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UNC5CO95185 931 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DRD2P14416 443 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF24P17028 368 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOX3P41225 446 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF844Q08AG5 666 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MPEG1Q2M385 716 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CROCCP2Q86T23 111 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C9orf40Q8IXQ3 194 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FRMD6Q96NE9 622 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GIMAP4Q9NUV9 329 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYSRT1A8MQ03 144 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PEX1O43933 1283 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEMA7AO75326 666 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERLIN1O75477 346 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL3P08700 152 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MST1P26927 711 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SERPINB3P29508 390 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH3A1P30838 453 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FEN1P39748 380 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GSTM5P46439 218 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MEOX1P50221 254 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TDGF1P3P51864 188 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNK10P57789 538 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTL4Q6ZR62 310 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF227Q86WZ6 799 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAGAPQ8N103 731 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSD4Q8NDX1 1056 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SGCZQ96LD1 299 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EBPLQ9BY08 206 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms