RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241		A8MUI8	341 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLITRK5	O94991	958 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	IL3	P08700	152 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ASMT	P46597	345 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF10	P50591	281 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ID2	Q02363	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	BST1	Q10588	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TTMP	Q5BVD1	217 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SORT1	Q99523	831 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ITM2A	O43736	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TBX19	O60806	448 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	VPS4B	O75351	444 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	WDPCP	O95876	746 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	IFI6	P09912	130 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CD97	P48960	835 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	HK2	P52789	917 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FUT7	Q11130	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF675	Q8TD23	568 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF681	Q96N22	645 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	NPAS2	Q99743	824 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MYOT	Q9UBF9	498 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	HEY2	Q9UBP5	337 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	GABRR3	A8MPY1	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RNF4	P78317	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf80	Q0P641	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MPEG1	Q2M385	716 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC15A4	Q8N697	577 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241		Q8NA96	180 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ASIC5	Q9NY37	505 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CFL2	Q9Y281	166 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC28A2	O43868	658 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PRPS2	P11908	318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SDC1	P18827	310 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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