RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 NAGLUP54802 743 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CFAP157Q5JU67 520 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 FRMD7Q6ZUT3 714 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 TRABD2AQ86V40 505 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 NUBPLQ8TB37 319 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ASB15Q8WXK1 588 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 RIT1Q92963 219 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 UCN3Q969E3 161 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 RASL10BQ96S79 203 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ACPTQ9BZG2 426 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 OXSMQ9NWU1 459 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC5A6Q9Y289 635 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf226A1L170 272 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 A8MVJ9 347 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 HRKO00198 91 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 WWP2O00308 870 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 OR6B1O95007 311 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PRF1P14222 555 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CHN1P15882 459 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNK10P57789 538 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVK-8P63133 956 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 MPEG1Q2M385 716 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SPIN4Q56A73 249 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 LIPMQ5VYY2 423 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 GFRALQ6UXV0 394 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 C9orf40Q8IXQ3 194 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 MREGQ8N565 214 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 OR4K14Q8NGD5 310 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 APOPT1Q96IL0 206 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PHF12Q96QT6 1004 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNA7Q96RP8 456 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CNPPD1Q9BV87 410 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 HPF1Q9NWY4 346 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC14L3Q9UDX4 400 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 MCM8Q9UJA3 840 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PLLPQ9Y342 182 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 TIMM22Q9Y584 194 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CROCCQ5TZA2 2017 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1W2PS29 197 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SERTM1A2A2V5 107 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 UNC5CO95185 931 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 STSP08842 583 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SOX3P41225 446 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXA1P55317 472 aa13.1□□□□□ -0.31
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SH3BP4-205ENST00000444916 HMGCS1Q01581 520 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ACSM2AQ08AH3 577 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ACSM2BQ68CK6 577 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC48A1Q6P1K1 146 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF111Q6ZNA4 994 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 MDGA2Q7Z553 956 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 C10orf107Q8IVU9 208 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 BANPQ8N9N5 519 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 POGLUT1Q8NBL1 392 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 DOK4Q8TEW6 326 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 FAIM2Q9BWQ8 316 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PARD6BQ9BYG5 372 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CXorf21Q9HAI6 301 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CES1P1Q9UKY3 287 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PDZD2O15018 2839 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 OR6C76A6NM76 312 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PEX1O43933 1283 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDH7O60245 1069 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CRCPO75575 148 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 CPMP14384 443 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PORP16435 677 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF24P17028 368 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 MEOX1P50221 254 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 XKP51811 444 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC37A1P57057 533 aa13.09□□□□□ -0.31
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