RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 ATG16L1Q676U5 607 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC6A19Q695T7 634 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF721Q8TF20 911 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 RIT1Q92963 219 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 C19orf60Q96EN9 201 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 EGLN2Q96KS0 407 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 FCRL1Q96LA6 429 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 MYNNQ9NPC7 610 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 THAP1Q9NVV9 213 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-202ENST00000410062 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 WDPCPO95876 746 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 GSTM5P46439 218 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ARG2P78540 354 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 BEST3Q8N1M1 668 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CCT7Q99832 543 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 DYTNA2CJ06 578 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 SUV39H1O43463 412 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 DYRK3O43781 588 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PTGER1P34995 402 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ERVK-8P63133 956 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 DUSP2Q05923 314 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 COPS7AQ9UBW8 275 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ERVK-19Q9WJR5 959 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 SDC1P18827 310 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 DDCP20711 480 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 NT5EP21589 574 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 GALNSP34059 522 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 HK2P52789 917 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP2R2AP63151 447 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 HSDL2Q6YN16 418 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 HAS2Q92819 552 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXL20Q96IG2 436 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF681Q96N22 645 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CXorf21Q9HAI6 301 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ZFAND5O76080 213 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 IGKV3-11P04433 115 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CT62P0C5K7 136 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 MLF1P58340 268 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 Q6ZS92 163 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TICAM1Q8IUC6 712 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PNPLA2Q96AD5 504 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TSSK3Q96PN8 268 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 C1orf50Q9BV19 199 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 EHD3Q9NZN3 535 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF462Q96JM2 2506 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 GABRR3A8MPY1 467 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 BCKDHAP12694 445 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 OCRLQ01968 901 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 LGI4Q8N135 537 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 Q8NA96 180 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ART5Q96L15 291 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 NUF2Q9BZD4 464 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ABI3Q9P2A4 366 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 LRATO95237 230 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP1B1P05026 303 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 KITP10721 976 aa22.16■■□□□ 1.14
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