RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 LAMP1P11279 417 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KCNJ5P48544 419 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 DPPA4Q7L190 304 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 BRF2Q9HAW0 419 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KLF15Q9UIH9 416 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0G2JPF8 293 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ANHXE9PGG2 379 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SCO2O43819 266 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ETFAP13804 333 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CBLP22681 906 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR26Q8NDV2 337 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SGTBQ96EQ0 304 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CSN2P05814 226 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HOXC13P31276 330 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 STX12Q86Y82 276 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OR7G3Q8NG95 312 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MYO9BQ13459 2157 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM3CQ92520 227 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RARRES3Q9UL19 164 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CLRN1P58418 232 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 APIPQ96GX9 242 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM19Q96HH6 336 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TREX1Q9NSU2 369 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 J3QRK9 145 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 AURKAO14965 403 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NDUFV2P19404 249 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FUZQ9BT04 418 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CA14Q9ULX7 337 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 C11orf98E9PRG8 122 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR37L1O60883 481 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ATF6P18850 670 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PTNP21246 168 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MLLT10P55197 1068 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 DEFB103AP81534 67 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GPAT4Q86UL3 456 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SGCDQ92629 289 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MYRFLQ96LU7 910 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MNTQ99583 582 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MTG2Q9H4K7 406 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PADI2Q9Y2J8 665 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RGPD5Q99666 1765 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SYNGR4O95473 234 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ADAP00813 363 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PLP2Q04941 152 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 POU4F2Q12837 409 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 THAP4Q8WY91 577 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SOBPA7XYQ1 873 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 APOC1P02654 83 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SPARCP09486 303 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 IL1RNP18510 177 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GSTM2P28161 218 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RORAP35398 523 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NNATQ16517 81 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ODF4Q2M2E3 257 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PKDCCQ504Y2 493 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms