RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 C3orf30Q96M34 536 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SYT11Q9BT88 431 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPL8 197 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 WASH3PC4AMC7 463 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LDB2O43679 373 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GRIN3BO60391 1043 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SCO1O75880 301 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SNAPINO95295 136 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ETFAP13804 333 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 DDOSTP39656 456 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GCGRP47871 477 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GGHQ92820 318 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NT5C3BQ969T7 300 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 C3orf49Q96BT1 292 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RTP4Q96DX8 246 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CHFRQ96EP1 664 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GABARAPO95166 117 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CLDN7O95471 211 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 IFNA2P01563 188 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CYP17A1P05093 508 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GABRB3P28472 473 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GJA5P36382 358 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 DLSTP36957 453 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CLDN8P56748 225 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 INAVAQ3KP66 663 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 HES5Q5TA89 166 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CES4AQ5XG92 561 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SVBPQ8N300 66 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 HMGB4Q8WW32 186 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NSMAFQ92636 917 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 USP22Q9UPT9 525 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ACOT8O14734 319 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 TPPPO94811 219 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ADAP00813 363 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ARSAP15289 507 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 AKR1C4P17516 323 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PFKLP17858 780 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 FDXRP22570 491 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 S100PP25815 95 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 IGFALSP35858 605 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LSSP48449 732 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CAMLGP49069 296 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ARSDP51689 593 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ZNF33AQ06730 810 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 INCA1Q0VD86 236 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CHAF1BQ13112 559 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 MICAQ29983 383 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 MAVSQ7Z434 540 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NATD1Q8N6N6 113 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 STK35Q8TDR2 534 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 KCNN1Q92952 543 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RGMAQ96B86 450 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LMLNQ96KR4 655 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 VNN3Q9NY84 501 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 OR12D1P0DN82 309 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SLC6A6P31641 620 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CAV3P56539 151 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ZNF33BQ06732 778 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 MBTPS1Q14703 1052 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 OPCMLQ14982 345 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LNX2Q8N448 690 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 AP1S3Q96PC3 154 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 OR2AG1Q9H205 316 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NIPAL2Q9H841 368 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RDH14Q9HBH5 336 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PCTPQ9UKL6 214 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms