RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SPASTQ9UBP0 616 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJB9Q9UBS3 223 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 POMT2Q9UKY4 750 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 AURKCQ9UQB9 309 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SOCS2O14508 198 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GSTA4O15217 222 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 P2RX6O15547 441 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 B4GALT2O60909 372 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PRKD3O94806 890 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 CKMT2P17540 419 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MAOBP27338 520 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 SLAMF1Q13291 335 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf61Q13536 156 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 BLMHQ13867 455 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MYBPC3Q14896 1274 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 GCNT6Q5T4J0 391 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 OOSP2Q86WS3 158 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 LYRM4Q9HD34 91 aa5.68□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NTMQ9P121 344 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RPS6KA6Q9UK32 745 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa5.68□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0G2JN53 185 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GSAPA4D1B5 854 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FAM149AA5PLN7 773 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 URADA6NGE7 173 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 B4DGG1 531 aa5.67□□□□□ -1.5
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