RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 CAB39LQ9H9S4 337 aa12.01□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 DMRT3Q9NQL9 472 aa12.01□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR6C76A6NM76 312 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SH3BGRLO75368 114 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPR75O95800 540 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL2RAP01589 272 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAF1P04049 648 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 S100BP04271 92 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCNAP12004 261 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 STMN1P16949 149 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TCP1P17987 556 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 GALNSP34059 522 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARFIP1P53367 373 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC37A1P57057 533 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 DR1Q01658 176 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPRED3Q2MJR0 410 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 DEFB113Q30KQ7 82 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 C18orf63Q68DL7 685 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PAMR1Q6UXH9 720 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 RNF111Q6ZNA4 994 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIF18BQ86Y91 864 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PM20D2Q8IYS1 436 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAGAPQ8N103 731 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 STAG3L4Q8TBR4 150 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TP53INP1Q96A56 240 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 WWTR1Q9GZV5 400 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRDM14Q9GZV8 571 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR51B5Q9H339 312 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PHF11Q9UIL8 331 aa12□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 CD8B2A6NJW9 211 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 CAPN14A8MX76 684 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TP53I11O14683 189 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIAS1O75925 651 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SNX4O95219 450 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 GOSR1O95249 250 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATE1O95260 518 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 HPNP05981 417 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 DRD2P14416 443 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 GDF1P27539 372 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIK3CBP42338 1070 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF136P52737 540 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 HERVK_113P63132 956 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERVK-8P63133 956 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNFRSF17Q02223 184 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 VASNQ6EMK4 673 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 CYS1Q717R9 158 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ISCA2Q86U28 154 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 BIVMQ86UB2 503 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 DOK4Q8TEW6 326 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 DIO2Q92813 273 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 RIT1Q92963 219 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF597Q96LX8 424 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 GAL3ST4Q96RP7 486 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPR22Q99680 433 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 CENPKQ9BS16 269 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERVK-6Q9BXR3 956 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBQLN3Q9H347 655 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 RNF112Q9ULX5 631 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERVK-19Q9WJR5 959 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 WASHC1A8K0Z3 465 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 K7EPI3 171 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLPP1O14494 284 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR10H2O60403 315 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAPPC6AO75865 159 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRATO95237 230 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ACSL3O95573 720 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLPSP04118 112 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC35E2BP0CK96 405 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC35E2P0CK97 266 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 TACR1P25103 407 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 HOXC12P31275 282 aa11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAP1GDS1P52306 607 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms