RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 GMPRP36959 345 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 LRP8Q14114 963 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OCLNQ16625 522 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 KDELC1Q6UW63 502 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZSR6 202 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PAQR7Q86WK9 346 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ETAA1Q9NY74 926 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 USP3Q9Y6I4 520 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 FLRT2O43155 660 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTS4O75173 837 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RHCEP18577 417 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HTR6P50406 440 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CLCN2P51788 898 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CAPZA1P52907 286 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CASP6P55212 293 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ST3GAL4Q11206 333 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MOGSQ13724 837 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GRIN2CQ14957 1233 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CLCA4Q14CN2 919 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SEC23BQ15437 767 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 LPAL2Q16609 132 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 IER5LQ5T953 404 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 LIPIQ6XZB0 460 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SGTBQ96EQ0 304 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ACSL6Q9UKU0 697 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CHD4Q14839 1912 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 XPNPEP2O43895 674 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 P04436 131 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RBM34P42696 430 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GLP1RP43220 463 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SOX2P48431 317 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR2B6P58173 313 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 BNIP3Q12983 259 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SERTAD2Q14140 314 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ATP6AP1Q15904 470 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ALG10Q5BKT4 473 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MUS81Q96NY9 551 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 KCNK12Q9HB15 430 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SARDHQ9UL12 918 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RNF6Q9Y252 685 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 STRCQ7RTU9 1775 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GXYLT2A0PJZ3 443 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 VAMP1P23763 118 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 NUDT1P36639 197 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GAS6Q14393 721 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZMYND11Q15326 602 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HMGN2P46Q86SG4 172 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TEX26Q8N6G2 289 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CD200R1Q8TD46 325 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 BMFQ96LC9 184 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CHIAQ9BZP6 476 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 H2BFMP0C1H6 154 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 LAMP1P11279 417 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ETFAP13804 333 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RCAN2Q14206 197 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SLC36A3Q495N2 470 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 COQ5Q5HYK3 327 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF773Q6PK81 442 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF615Q8N8J6 731 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GPR150Q8NGU9 434 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms