RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KLK4Q9Y5K2 254 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DSPPQ9NZW4 1301 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB10A6NFE3 127 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBX1O43435 398 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MPZL2O60487 215 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBX19O60806 448 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA3DO95025 777 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 IGFBP4P22692 258 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 LTBRP36941 435 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CLCNKAP51800 687 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RD3Q7Z3Z2 195 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PDZD3Q86UT5 571 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KBTBD8Q8NFY9 601 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF167Q9H6Y7 350 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52A4PA6NMU1 304 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXD12P35452 270 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS26P62854 115 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf48Q6RUI8 117 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF367Q7RTV3 350 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 AMZ2Q86W34 360 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPOQ9BU64 300 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCG4Q9H172 646 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TAS2R16Q9NYV7 291 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DENND4AQ7Z401 1863 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ASGR2P07307 311 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ERGP11308 486 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CNR2P34972 360 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 BSGP35613 385 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PTCHD4Q6ZW05 846 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SCAIQ8N9R8 606 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD53Q8N9V6 530 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR32P1Q8NGA4 272 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A8Q9BY19 250 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 QPCTLQ9NXS2 382 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQU0 124 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MFN2O95140 757 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC15A1P46059 708 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPK12P53778 367 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAM15Q13444 863 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNJ8Q15842 424 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL2A1Q16548 175 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM52BQ4KMG9 183 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf64Q86WR6 236 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TAGAPQ8N103 731 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PARP16Q8N5Y8 322 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 POC5Q8NA72 575 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNDC15Q96J42 360 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 F2RL3Q96RI0 385 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0G2JN53 185 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FEZF1A0PJY2 475 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKDD1BA6NHY2 528 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM227AF5H4B4 570 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZW10O43264 779 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA7AO75326 666 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 BCHEP06276 602 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MANFP55145 182 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TPTEP56180 551 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2CBP62714 309 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2CAP67775 309 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 NATD1Q8N6N6 113 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 HTRA1Q92743 480 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM19Q96HH6 336 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5M11Q96RB7 305 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MACROD1Q9BQ69 325 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CLN6Q9NWW5 311 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 C5orf58C9J3I9 102 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 B4GALT2O60909 372 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNK2O95069 426 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RPA4Q13156 261 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 IL17RCQ8NAC3 791 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms