RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 SSX1Q16384 188 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 CCDC58Q4VC31 144 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 SAXO2Q658L1 398 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 RNF180Q86T96 592 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 GHDCQ8N2G8 530 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 GPR156Q8NFN8 814 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 OR7G3Q8NG95 312 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MOAP1Q96BY2 351 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 GLS2Q9UI32 602 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 KLF15Q9UIH9 416 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 FBXO10Q9UK96 956 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PLXNA3P51805 1871 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 SHOXO15266 292 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 GRM6O15303 877 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 POU2F1P14859 743 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 GPC1P35052 558 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 CRISP3P54108 245 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 AP3S2P59780 193 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MXD1Q05195 221 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 BAMBIQ13145 260 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 OR56A3Q8NH54 315 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PIGXQ8TBF5 258 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 OSTF1Q92882 214 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 RFT1Q96AA3 541 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PDXPQ96GD0 296 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MMP28Q9H239 520 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ICKQ9UPZ9 632 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 ALG5Q9Y673 324 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-202ENST00000320122 GSAPA4D1B5 854 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PCDH17O14917 1159 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PLD2O14939 933 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 SEPT4O43236 478 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 TMEM127O75204 238 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 SLCO2B1O94956 709 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 EPORP19235 508 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 TNNI3P19429 210 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 LHCGRP22888 699 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 NTSP30990 170 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 GRK5P34947 590 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 LIMS1P48059 325 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 SPINT3P49223 89 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 RAG2P55895 527 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 GALK2Q01415 458 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 SLC14A1Q13336 389 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PDE7AQ13946 482 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 GINS1Q14691 196 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 STK11Q15831 433 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 C22orf42Q6IC83 251 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 CNIH2Q6PI25 160 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-202ENST00000320122 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms