RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 G0S2P27469 103 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ARNTP27540 789 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 SLC1A2P43004 574 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 GATA4P43694 442 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 DEFA1P59665 94 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 DEFA3P59666 94 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 SH3BP2P78314 561 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CDK5R2Q13319 367 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 IMPG1Q17R60 797 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 RABL3Q5HYI8 236 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 AGAP6Q5VW22 663 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 MLIPQ5VWP3 458 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ZNF544Q6NX49 715 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PNCKQ6P2M8 343 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ISCA2Q86U28 154 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 IFNEQ86WN2 208 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 NRROSQ86YC3 692 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 TIGD4Q8IY51 512 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 RSC1A1Q92681 617 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 C12orf42Q96LP6 360 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 AGAP4Q96P64 663 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 MBOAT4Q96T53 435 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 IL12RB2Q99665 862 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 EXD2Q9NVH0 621 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 SCN3BQ9NY72 215 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 VPS4AQ9UN37 437 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 RLFQ13129 1914 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 C2orf74A8MZ97 194 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ARNTLO00327 626 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 HBP1O60381 514 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 GPR32O75388 356 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CCNKO75909 580 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 KCNK2O95069 426 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 MBP02144 154 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CYBBP04839 570 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ANXA5P08758 320 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CD3GP09693 182 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 IQCF3P0C7M6 154 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 COX5BP10606 129 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ITGAMP11215 1152 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 LCP1P13796 627 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 NCK1P16333 377 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 IL1RNP18510 177 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 MSR1P21757 451 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CCNOP22674 350 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PGGT1BP53609 377 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 GEMP55040 296 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 GNG2P59768 71 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 COPZ1P61923 177 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 SLC35A2P78381 396 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PRKCDQ05655 676 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ZNF404Q494X3 552 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 PYCR3Q53H96 274 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 EOGTQ5NDL2 527 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 HES5Q5TA89 166 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CDC73Q6P1J9 531 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 TSSK4Q6SA08 328 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 MCFD2Q8NI22 146 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 ITFG1Q8TB96 612 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 CCDC115Q96NT0 180 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 VPS35Q96QK1 796 aa8.69□□□□□ -1.02
MMP3-201ENST00000299855 APOL2Q9BQE5 337 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms