RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 HSPB11Q9Y547 144 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ALG5Q9Y673 324 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 TSPAN11A1L157 253 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC35F4A4IF30 521 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PLD2O14939 933 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CSO75390 466 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 OR2B3O76000 313 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CCNB2O95067 398 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CDRT1O95170 752 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 LAMP1P11279 417 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 COX7A2P14406 83 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF30P17039 623 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 POU1F1P28069 291 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PREPP48147 710 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 RPIAP49247 311 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 HYAL1Q12794 435 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 MTAPQ13126 283 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 QPRTQ15274 297 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ENKURQ8TC29 256 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ARL15Q9NXU5 204 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PCDH7O60245 1069 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 DPM1O60762 260 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 MMP20O60882 483 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 AMD1P17707 334 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ALAS2P22557 587 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CNR2P34972 360 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 OPRD1P41143 372 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 TNK1Q13470 666 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 VEZF1Q14119 521 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 GPR19Q15760 415 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PYDC2Q56P42 97 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 XKRXQ6PP77 449 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PARM1Q6UWI2 310 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 SYT12Q8IV01 421 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC34A3Q8N130 599 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 NAGSQ8N159 534 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 FGF14Q92915 247 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 GLTPQ9NZD2 209 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM227AF5H4B4 570 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ADAMDEC1O15204 470 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 TSPAN6O43657 245 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ENTPD6O75354 484 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 TSPAN19P0C672 248 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ANXA8P13928 327 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 PRKACAP17612 351 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 GJA4P35212 333 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 MAPK12P53778 367 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CPA6Q8N4T0 437 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 TMEM203Q969S6 136 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CHST8Q9H2A9 424 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 LRRTM2O43300 516 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 PRAMEF4O60810 478 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 TSC22D2O75157 780 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 PDGFAP04085 211 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 HBQ1P09105 142 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 HLA-DMAP28067 261 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 SELENOWP63302 87 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 ABRQ12979 859 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 GAB1Q13480 694 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 RHCGQ9UBD6 479 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 SH3BGRLO75368 114 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRTM1-201ENST00000295057 AP2A2O94973 939 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms