RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 C3orf30Q96M34 536 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 FKBP7Q9Y680 259 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 SOBPA7XYQ1 873 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 VILLO15195 856 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 XPNPEP2O43895 674 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 KLHL18O94889 574 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RAB36O95755 333 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 HSD11B1P28845 292 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ACSL1P33121 698 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 SLC6A9P48067 706 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RGNQ15493 299 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 SLC36A3Q495N2 470 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 PDSS1Q5T2R2 415 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RNF121Q9H920 327 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 MLLT10P55197 1068 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 C1orf189Q5VU69 101 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 DKKL1Q9UK85 242 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 BCORQ6W2J9 1755 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RFXAPO00287 272 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CACNG3O60359 315 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 MYOGP15173 224 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CERS1P27544 350 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 SLC9A3P48764 834 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CDKL1Q00532 357 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 MBTPS1Q14703 1052 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 NAGSQ8N159 534 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 OR51A7Q8NH64 312 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 TMCO6Q96DC7 493 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RBP7Q96R05 134 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ARL6IP5O75915 188 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 MS4A2Q01362 244 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 GBX1Q14549 363 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 SERINC2Q96SA4 455 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 PRODHO43272 600 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RNF13O43567 381 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CCNKO75909 580 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 HOXA9P31269 272 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 LHX8Q68G74 356 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 OR2T33Q8NG76 320 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 EVPLQ92817 2033 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 A0A1B0GVT2 93 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 A0A1W2PRG6 482 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 PRSS38A1L453 326 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ZNF879B4DU55 563 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 IRS1P35568 1242 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 BCAP31P51572 246 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 LINGO2Q7L985 606 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CMKLR1Q99788 373 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 SARDHQ9UL12 918 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RNF6Q9Y252 685 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ABCA3Q99758 1704 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 A0A0G2JNG1 304 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 NUDT1P36639 197 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ST3GAL4Q11206 333 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 TUBA3CQ13748 450 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 KIR2DS5Q14953 304 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 PITPNAQ00169 270 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 NPRL3Q12980 569 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 NETO1Q8TDF5 533 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 ARRDC3Q96B67 414 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 TM9SF2Q99805 663 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 GNG8Q9UK08 70 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 A0A0G2JPF8 293 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CTBSQ01459 385 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 OR2L5Q8NG80 312 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RLN3Q8WXF3 142 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 DDCP20711 480 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 GSTM2P28161 218 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 CRISP1P54107 249 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 P4HA3Q7Z4N8 544 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms