RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TANKQ92844 425 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NANOGQ9H9S0 305 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HCN2Q9UL51 889 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LATO43561 262 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MAFKO60675 156 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TBX10O75333 385 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DIRAS3O95661 229 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NRLP54845 237 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RAB8AP61006 207 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLAMF1Q13291 335 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MLC1Q15049 377 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UNC50Q53HI1 259 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HACD4Q5VWC8 232 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LCTLQ6UWM7 567 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GIMAP5Q96F15 307 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MYADMQ96S97 322 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR6C74A6NCV1 312 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SDHDO14521 159 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 JRKO75564 520 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RFPL1O75677 317 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC10A3P09131 477 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UCHL1P09936 223 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF35P13682 527 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CSNK1DP48730 415 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RAB11BQ15907 218 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MEP1AQ16819 746 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMEM225Q6GV28 225 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LCN8Q6JVE9 175 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 COQ8AQ8NI60 647 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 M0R036 132 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 BRINP1O60477 761 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RBBP9O75884 186 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OAZ2O95190 189 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PNMTP11086 282 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NDUFV2P19404 249 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ETV3P41162 512 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HTR3AP46098 478 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PRPS1P60891 318 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RAB5BP61020 215 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SERTAD2Q14140 314 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GRM7Q14831 915 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FIBINQ8TAL6 211 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ISOC1Q96CN7 298 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PGAM5Q96HS1 289 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RARRES3Q9UL19 164 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KCTD3Q9Y597 815 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 EFCAB7A8K855 629 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TOR1BO14657 336 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SCAMP1O15126 338 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KCNK5O95279 499 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CSN2P05814 226 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CFHP08603 1231 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HSD17B1P14061 328 aa6.9□□□□□ -1.3
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