RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000087050.6

Col4a4-201, Transcript of Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col4a4, Length 10,108 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4-201ENSMUST00000087050 UbbP0CG49 305 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 UbcP0CG50 734 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Uba52P62984 128 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Trappc13Q3TIR1 417 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Elf3Q3UPW2 391 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Map3k3Q61084 626 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr821Q8VG45 310 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Pcdhga12Q91XY7 932 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Nt5c1bQ91YE9 573 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Mcoln1Q99J21 580 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Alg14Q9D081 217 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Dapl1Q9D757 107 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Clic3Q9D7P7 237 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Dtwd1Q9D8U7 304 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tprg1lQ9DBS2 266 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rp2Q9EPK2 347 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 TncQ80YX1 2110 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm3327F7C9A1 213 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 S1pr1O08530 382 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Scarb2O35114 478 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tubg1P83887 451 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 F8a1Q00558 380 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 HgfQ08048 728 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Q504N7 393 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Asb8Q91ZT9 288 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rnf181Q9CY62 165 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Slc6a14Q9JMA9 638 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Nr1h5E9Q5A6 505 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ntrk2P15209 821 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gch1Q05915 241 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Arl5cQ6P068 179 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Adam20Q7M763 760 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr907Q7TRC7 310 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Npas4Q8BGD7 802 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Psapl1Q8C1C1 522 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Dpep2Q8C255 478 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Sec14l4Q8R0F9 403 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Lipt1Q8VCM4 373 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Alg2Q9DBE8 415 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Prss16Q9QXE5 509 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tmsb15aA2AEH9 79 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr613E9PYB4 317 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Zfp605E9QAH2 694 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tgfb3P17125 410 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Zp2P20239 713 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Slain1Q68FF7 579 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rhox11Q810N8 206 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Sult2a8Q8BGL3 282 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr846Q8VET8 312 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Slc33a1Q99J27 550 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Btf3l4Q9CQH7 158 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Clec2iQ9WVF9 217 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm14139F6ZS36 494 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tmem200cJ3QK46 637 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cd28P31041 218 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Mgat4bQ812F8 548 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rxfp3Q8BGE9 472 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Padi6Q8K3V4 682 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr970Q8VFN3 311 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Actl6bQ99MR0 426 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rpl14Q9CR57 217 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Il20Q9JKV9 176 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cacna1eQ61290 2272 aa9.59□□□□□ -0.87
Col4a4-201ENSMUST00000087050 PoleQ9WVF7 2283 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm3676D3Z236 184 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Coq10aE9Q3H6 259 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm3573L7N292 184 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 EdnrbP48302 442 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ofcc1Q8BGX4 166 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Lrrc20Q8CI70 184 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Acot7Q91V12 381 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ctrb1Q9CR35 263 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ppil3Q9D6L8 161 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 1700001F09RikQ9DAR5 184 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 GghQ9Z0L8 317 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Vamp5Q9Z2P8 102 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm4181E9Q7X3 184 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Mmp10O55123 476 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 ChadO55226 358 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Kcnj5P48545 419 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gas6Q61592 674 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Fbxl19Q6PB97 674 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Eid2Q6X7S9 236 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr765Q7TRI6 309 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Trim23Q8BGX0 574 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 PxkQ8BX57 582 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Kcnc4Q8R1C0 628 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr767Q8VG33 309 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr394Q8VGR5 310 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ints12Q9D168 461 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cntn6Q9JMB8 1028 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Scn1aA2APX8 2009 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cd68P31996 326 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 TifaQ793I8 184 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Olfr1045Q7TR80 315 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gpr176Q80WT4 515 aa9.58□□□□□ -0.88
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Slfnl1Q8BHW9 410 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms