RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hebp2Q9WU63 205 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dip2cE9PWR4 1557 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Smpd2O70572 419 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Scrg1O88745 98 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nr4a1P12813 601 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tnfsf9P41274 309 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kcnn3P58391 732 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ces2bQ6PDB7 556 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pttg1ipQ8R143 174 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SelenomQ8VHC3 145 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cnot11Q9CWN7 505 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cby1Q9D1C2 127 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 IckQ9JKV2 629 aa10.71□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm20715E9Q3L7 95 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmigd3G3X8R9 209 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cops3O88543 423 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 UevldQ3U1V6 471 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prmt8Q6PAK3 394 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 B430306N03RikQ6QX36 289 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dnajb13Q80Y75 316 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfm2Q8BM13 448 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Smyd4Q8BTK5 799 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttc34Q8C0Q3 554 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc31a1Q8K211 196 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NpntQ91V88 561 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MvdQ99JF5 401 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nop16Q9CPT5 178 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q9D979 236 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cpne6Q9Z140 557 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm2022A0A1Y7VLT7 144 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ccrl2O35457 360 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 UradQ283N4 178 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SynaQ5G5D5 617 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wipi2Q80W47 445 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acsl5Q8JZR0 683 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1309Q8VF83 320 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr820Q8VFU5 312 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1351Q8VGU6 319 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Spaca7Q9D2S4 182 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q9DA42 136 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp68Q9Z116 606 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TspearJ3S6Y1 670 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dpf3P58269 378 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rps24P62849 133 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NnatQ61979 81 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vwa2Q70UZ7 791 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmprss11dQ8VHK8 417 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mrpl49Q9CQ40 166 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mcemp1Q9D8U6 183 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Extl1Q9JKV7 669 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 IsxA1A546 240 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tnfrsf18O35714 228 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sox1P53783 391 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sox3P53784 375 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rps26P62855 115 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf583Q3V080 568 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gpr17Q6NS65 339 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pced1aQ6P1Z5 449 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ca12Q8CI85 354 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1466Q8VFW4 310 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdkal1Q91WE6 578 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dnaja3Q99M87 480 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q9CQC3 228 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TtpalQ9D3D0 343 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nxnl2Q9D531 156 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Loxl3Q9Z175 754 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Skint10A7TZG1 354 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ankrd37Q569N2 159 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CstbQ62426 98 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CochQ62507 552 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nadsyn1Q711T7 725 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Camk2gQ923T9 529 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Exosc5Q9CRA8 235 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dcaf4A0A1Y7VNZ0 532 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 4930558K02RikE0CXC6 182 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Crisp4E9PVG4 293 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AregP31955 248 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pcdhga7Q6DD96 935 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NarflQ7TMW6 476 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr651Q8VG78 313 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Eef1akmt1Q9CY45 214 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mtif3Q9CZD5 276 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm26992S4R1A3 76 aa10.7□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GzmkO35205 263 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam149aQ8CFV2 787 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q8K039 155 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SharpinQ91WA6 380 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr705Q9EPF7 316 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Spock2Q9ER58 423 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc43a3A2AVZ9 502 aa10.69□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bcl2a1dO55179 172 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms