RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HaghlQ9DB32 283 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AcoxlQ9DBS4 632 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RttnQ8R4Y8 2226 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plce1Q8K4S1 2282 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddi2A2ADY9 399 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prr36E9PV26 1098 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Catsperg1E9Q355 1151 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zw10O54692 779 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab8bP61028 207 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myadml2Q08AU7 307 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc27a5Q4LDG0 689 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Orm1Q60590 207 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OclnQ61146 521 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam167aQ6P1G6 215 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd9Q8BH83 326 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl3Q8C3P7 580 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp57Q8C6P8 421 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2afjQ8R1M2 129 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col25a1Q99MQ5 666 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ift43Q9DA69 206 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssr3Q9DCF9 185 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Jph3Q9ET77 744 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gmeb1Q9JL60 562 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr49Q9Z1V0 313 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BC034090A0A087WP46 1202 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clip3B9EHT4 547 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gas2P11862 314 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad51Q08297 339 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MedagQ14BA6 303 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk10Q3UMM4 360 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex10Q3URQ0 928 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BC030870Q3V2G4 71 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BspryQ80YW5 473 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galnt12Q8BGT9 576 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acp6Q8BP40 418 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psg23Q9D2U0 471 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psg21Q9DAV5 471 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr630Q9EQQ7 319 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nkx1-1G3UXB3 402 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapk12O08911 367 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HpnO35453 436 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtprjQ64455 1238 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Awat2Q6E1M8 333 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Padi6Q8K3V4 682 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RragcQ99K70 398 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MmabQ9D273 237 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ralgps2Q9ERD6 590 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapk11Q9WUI1 364 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B4galt6Q9WVK5 382 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trmt1lA2RSY6 728 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou3f2P31360 445 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp30Q3UN04 517 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata13Q5DU57 656 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem199Q5SYH2 208 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AY358078Q6UY53 465 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf750Q8BH05 703 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Piwil4Q8CGT6 848 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgip1Q8VD37 806 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr811Q8VFI1 319 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Creb3l4Q9D2A5 370 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7145A0A087WS64 360 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CkmP07310 381 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srp54P14576 504 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nsg2P47759 171 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm853Q3UNZ2 425 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stox2Q499E5 926 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lamp3Q7TST5 411 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zik1Q80YP6 463 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lancl3Q8CD19 420 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TrhdeQ8K093 1025 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ntng1Q8R4G0 539 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1467Q8VFW1 308 aa15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem201A2A8U2 664 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efna3O08545 230 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FurinP23188 793 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apoc3P33622 99 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PgfP49764 158 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pde12Q3TIU4 608 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkl4Q3TZA2 342 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc17a4Q5NCM1 492 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pan3Q640Q5 837 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc123Q8CII2 336 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr45Q8VGM1 311 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spg21Q9CQC8 308 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd300ld4A2A7W1 245 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nxpe3B9EKK6 559 aa15.32■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dgcr6O35347 198 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.3 ms