RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 AHRP35869 848 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 XCR1P46094 333 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CCT5P48643 541 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 GSK3AP49840 483 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TNFSF10P50591 281 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SLC18A1P54219 525 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TAS2R50P59544 299 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 OCRLQ01968 901 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 BST1Q10588 318 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 LCP2Q13094 533 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 RUNX2Q13950 521 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 FAM53BQ14153 422 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 RCN2Q14257 317 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 POU4F3Q15319 338 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CHI3L2Q15782 390 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 DEFB134Q4QY38 66 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 KANK2Q63ZY3 851 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CGB2Q6NT52 195 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ACAD11Q709F0 780 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 NR4A3Q92570 626 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 HAS2Q92819 552 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF354BQ96LW1 612 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 C3orf30Q96M34 536 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 AIF1LQ9BQI0 150 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ACPTQ9BZG2 426 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ACTR8Q9H981 624 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 LANCL2Q9NS86 450 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SENP1Q9P0U3 644 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SEC14L3Q9UDX4 400 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 HAO1Q9UJM8 370 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CACNA1DQ01668 2161 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 PTPN13Q12923 2485 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 NCKAP5O14513 1909 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 A0A0A6YYD5 115 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 OR5H15A6NDH6 313 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 WIPF3A6NGB9 483 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CCL21O00585 134 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CLGNO14967 610 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TM9SF1O15321 606 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 NPHS1O60500 1241 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 UGDHO60701 494 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 PRAMEF2O60811 474 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ADAM11O75078 769 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 FBXO24O75426 580 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CLEC3AO75596 197 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SCELO95171 688 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 UNC5CO95185 931 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ZWINTO95229 277 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 NSA2O95478 260 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ESRRBO95718 433 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 MLYCDO95822 493 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TGFB1P01137 390 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 GBAP04062 536 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SERPINA6P08185 405 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 PCNAP12004 261 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CD1EP15812 388 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TAC1P20366 129 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 PPP2R1BP30154 601 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 GATA4P43694 442 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 CCNG1P51959 295 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 OR4D2P58180 307 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 SKP1P63208 163 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 HMGCS1Q01581 520 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00963-215ENST00000622972 DUSP2Q05923 314 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms