RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 NPIPA5E9PKD4 350 aa19.76■□□□□ 0.75
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PTPRJ-208ENST00000615445 RAB36O95755 333 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC6A11P48066 632 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCN2P51788 898 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 MEDAGQ5VYS4 303 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF852Q6ZMS4 543 aa19.76■□□□□ 0.75
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PTPRJ-208ENST00000615445 FAM3CQ92520 227 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 NPIPA1Q9UND3 350 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa19.76■□□□□ 0.75
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PTPRJ-208ENST00000615445 ECHDC3Q96DC8 303 aa19.76■□□□□ 0.75
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PTPRJ-208ENST00000615445 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 FANK1Q8TC84 345 aa19.75■□□□□ 0.75
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PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP19.74■□□□□ 0.751e-6■□□□□ 10
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PTPRJ-208ENST00000615445 MAPK14Q16539 360 aa19.74■□□□□ 0.75
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PTPRJ-208ENST00000615445 DEFB110Q30KQ9 67 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL10Q6ZVT0 673 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2T33Q8NG76 320 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ISOC1Q96CN7 298 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 PELI2Q9HAT8 420 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 H3BSH0 61 aa19.73■□□□□ 0.75
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