RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTPS2Q9NRF8 586 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPP7Q9UHL4 492 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCN2AQ99250 2005 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FUOMA2VDF0 154 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KMOO15229 486 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 REEP5Q00765 189 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF846Q147U1 533 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRMPD2BQ6IN97 320 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT13Q86X67 352 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYDGFQ969H8 173 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB7BQ96AH8 199 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGMAQ96B86 450 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR51E2Q9H255 320 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PELI2Q9HAT8 420 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC28A2O43868 658 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEMA3DO95025 777 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPN2P04844 631 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADORA3P0DMS8 318 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCR2P25025 360 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSR2P43308 183 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNC4Q03721 635 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR19Q15760 415 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA1211LQ6NV74 962 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MFSD4AQ8N468 514 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VMP1Q96GC9 406 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5M11Q96RB7 305 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX101Q9BY14 249 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLE4Q9NR33 117 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRIT2A6NDA9 550 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0R3H8 397 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGRMC2O15173 223 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR10H3O60404 316 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPC1P35052 558 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIE1P35590 1138 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSNK2BP67870 215 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNASE1L3Q13609 305 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT33BQ14525 404 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COLEC12Q5KU26 742 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR8K5Q8NH50 307 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAMK1GQ96NX5 476 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PALMDQ9NP74 551 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.18□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL6P41182 706 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRISP1P54107 249 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD300CQ08708 224 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM16LQ309B1 348 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CENPOQ9BU64 300 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR14Q9BWN1 585 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR51I1Q9H343 314 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FTSJ1Q9UET6 329 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDN24A6NM45 220 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBFA2T3O75081 653 aa11.17□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PBX2P40425 430 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms