RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 METTL4Q8N3J2 472 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF175Q8N4F7 328 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ARL8AQ96BM9 186 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SCMH1Q96GD3 660 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 F2RL3Q96RI0 385 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SERINC2Q96SA4 455 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 SERPINI1Q99574 410 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MECRQ9BV79 373 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 HES7Q9BYE0 225 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ACPTQ9BZG2 426 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 ASB4Q9Y574 426 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-210ENST00000588340 NINQ8N4C6 2090 aa6.4□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 FREM3P0C091 2139 aa6.4□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM120BA0PK00 339 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 ASPDHA6ND91 283 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CLDN4O14493 209 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 KLF11O14901 512 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TMPRSS11DO60235 418 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 ZG16O60844 167 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SPAG7O75391 227 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 NEURL1O76050 574 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 WISP2O76076 250 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TGFB1P01137 390 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 PDYNP01213 254 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SERPINE1P05121 402 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SP1P08047 785 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CD46P15529 392 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CERS1P27544 350 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SOX18P35713 384 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CLCN2P51788 898 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR143P51810 404 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 NEK2P51955 445 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 LIM2P55344 173 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 MLF1P58340 268 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TGM3Q08188 693 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC13A2Q13183 592 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 RCN2Q14257 317 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZSR9 355 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CHSY3Q70JA7 882 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 HDXQ7Z353 690 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 FJX1Q86VR8 437 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM47BQ8NA70 645 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 RELTQ969Z4 430 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 RGMAQ96B86 450 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 POM121Q96HA1 1249 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CSF3RQ99062 836 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SORT1Q99523 831 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 OR51B5Q9H339 312 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHL1Q9NR64 748 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 LRFN1Q9P244 771 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 SNX6Q9UNH7 406 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-210ENST00000588340 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms