RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232		A0A1W2PP18	115 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232		A0A1W2PQ72	361 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	PDPK1	O15530	556 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ALOX12B	O75342	701 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ATP1B1	P05026	303 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	HEXB	P07686	556 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	UMOD	P07911	640 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	IFI6	P09912	130 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SLC35E2	P0CK97	266 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CPM	P14384	443 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	MAOA	P21397	527 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	F8A1	P23610	371 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	PRDX6	P30041	224 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	S100A3	P33764	101 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	MPI	P34949	423 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	DLST	P36957	453 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	FOLR3	P41439	243 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	EMP2	P54851	167 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	WNT3	P56703	355 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	KCNK10	P57789	538 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	STX4	Q12846	297 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SSPN	Q14714	243 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	MAPRE2	Q15555	327 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	NSDHL	Q15738	373 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	FITM2	Q8N6M3	262 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	GATA6	Q92908	595 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SPDL1	Q96EA4	605 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CRB3	Q9BUF7	120 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	APC2	O95996	2303 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ACACA	Q13085	2346 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	OR2W5	A6NFC9	320 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC154	A6NI56	674 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CFLAR	O15519	480 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SLITRK5	O94991	958 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CAPNS1	P04632	268 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CD1E	P15812	388 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CAPN3	P20807	821 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	MMP11	P24347	488 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	NTS	P30990	170 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	STT3A	P46977	705 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	DGKQ	P52824	942 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CLN3	Q13286	438 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	KRT72	Q14CN4	511 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	TLR1	Q15399	786 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	TERF2	Q15554	542 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	PGS1	Q32NB8	556 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	COQ5	Q5HYK3	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	GK5	Q6ZS86	529 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	TREML1	Q86YW5	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF675	Q8TD23	568 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	TSLP	Q969D9	159 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC115	Q96NT0	180 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	OR52E6	Q96RD3	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	BBS4	Q96RK4	519 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	DPH1	Q9BZG8	443 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-211	ENST00000582232	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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