RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 AP3B1O00203 1094 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMCC2O75069 709 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACTL6AO96019 429 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CPN1P15169 458 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CERS1P27544 350 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD79BP40259 229 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLA2G16P53816 162 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAB1Q13480 694 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNX1Q13596 522 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERTAD2Q14140 314 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TOMM20Q15388 145 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TBCELQ5QJ74 424 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 VSTM4Q8IW00 320 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 WNT2BQ93097 391 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBXL8Q96CD0 374 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 RILPQ96NA2 401 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GBP4Q96PP9 640 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 UCN2Q96RP3 112 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERINC2Q96SA4 455 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1W2PNV4 684 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 KCNAB3O43448 404 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 HAUS5O94927 633 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GUCA1CO95843 209 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLAUP00749 431 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAMP19021 973 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 UGT2B10P36537 528 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC1A2P43004 574 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MSH2P43246 934 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MASP1P48740 699 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 RGS4P49798 205 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 AP1S2P56377 157 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SRYQ05066 204 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 VWA1Q6PCB0 445 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM64Q6YI46 380 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC89Q8N998 374 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR2L5Q8NG80 312 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 DOK4Q8TEW6 326 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATL1Q8WXF7 558 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCT6BQ92526 530 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 STARD4Q96DR4 205 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINGO1Q96FE5 620 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FETUBQ9UGM5 382 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A088AWK7 358 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 H0Y3Z8 333 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GNB5O14775 395 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLF4O43474 513 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPRIN2O60269 458 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNX4O95219 450 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TGM6O95932 706 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTPN6P29350 595 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 IDUAP35475 653 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 STT3AP46977 705 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MTTPP55157 894 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBXW4P57775 412 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 RCN2Q14257 317 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPA17Q15506 151 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ETFDHQ16134 617 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms