RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP10-9P60411 292 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 HERVK_113P63132 956 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-8P63133 956 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLIN5Q00G26 463 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFRSF17Q02223 184 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAV1Q03135 178 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOLH1Q04609 750 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBLBQ13191 982 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SETDB1Q15047 1291 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 RTL4Q6ZR62 310 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 EID3Q8N140 333 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 MORN4Q8NDC4 146 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM13CQ8NE31 585 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK15Q96Q40 435 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMC6Q96SB8 1091 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 CENPKQ9BS16 269 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS11Q9H270 941 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXO5Q9H790 373 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF358Q9NW07 568 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SYCE1LA8MT33 242 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMPRSS11DO60235 418 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR10H2O60403 315 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCELO95171 688 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACSL3O95573 720 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 AIFM1O95831 613 aa6.63□□□□□ -1.35
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGAP20933 346 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 TYK2P29597 1187 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINB1P30740 379 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASP2P42575 452 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 STT3AP46977 705 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCT5P48643 541 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINB8P50452 374 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEK2P51955 445 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUP107P57740 925 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNJ2P63252 427 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHEXP78562 749 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLE4Q04727 773 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 GTF2H2Q13888 395 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 EMC4Q5J8M3 183 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLC3Q6P597 504 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPN5Q6U736 354 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM64Q6YI46 380 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 GK5Q6ZS86 529 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR180Q86V85 440 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.63□□□□□ -1.35
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