RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL20	Q96IG2	436 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	HPF1	Q9NWY4	346 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TINAG	Q9UJW2	476 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC13	O75165	2243 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GLOD5	A6NK44	160 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN8	P19075	237 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B3	P37058	310 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR85	P60893	370 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	HSF1	Q00613	529 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MPEG1	Q2M385	716 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF787	Q6DD87	383 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL4	Q8N3J2	472 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGED4	Q96JG8	741 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		20.17	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	DLX3	O60479	287 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNS	P34059	522 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	RFC3	P40938	356 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CLC	Q05315	142 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT88	Q13099	833 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC50	Q53HI1	259 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	20.16	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PINLYP	A6NC86	204 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PGRMC2	O15173	223 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNHIT1	O43257	154 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PDYN	P01213	254 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK1	P06870	262 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35E2	P0CK97	266 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGER1	P34995	402 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGG	Q5H8A4	983 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX35	Q5T0J7	233 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MTFR2	Q6P444	385 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ART5	Q96L15	291 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM237	Q96Q45	408 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	BRF2	Q9HAW0	419 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		20.15	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JMM0	328 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPB8	328 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRS3	328 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PS29	197 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8R	I6L899	631 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DYRK3	O43781	588 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	HS6ST1	O60243	411 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CLPS	P04118	112 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TAC1	P20366	129 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP6	P55212	293 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SGO1	Q5FBB7	561 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RTL4	Q6ZR62	310 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CNPY4	Q8N129	248 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DOK4	Q8TEW6	326 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RIT1	Q92963	219 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SGCZ	Q96LD1	299 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR41	Q9HAD4	459 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	AHSP	Q9NZD4	102 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	APC	P25054	2843 aa		20.14	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4F21	O95013	312 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PYGB	P11216	843 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	IMPDH1	P20839	514 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAA2	P54646	552 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC37A1	P57057	533 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK-8	P63133	956 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		20.13	■□□□□ 0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ASPH	Q12797	758 aa		20.13	■□□□□ 0.81

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