RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPU	Q71F23	418 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		Q75L30	129 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	COMTD1	Q86VU5	262 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC43A2	Q8N370	569 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP8	Q8NA92	274 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RAET1E	Q8TD07	263 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GLYATL1	Q969I3	302 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ERGIC1	Q969X5	290 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PYCR2	Q96C36	320 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB39B	Q96DA2	213 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT74	Q96LB3	600 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS35	Q96QK1	796 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT12	Q99456	494 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HAUS8	Q9BT25	410 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GON7	Q9BXV9	100 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CALHM2	Q9HA72	323 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HPS4	Q9NQG7	708 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OSER1	Q9NX31	292 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RDH8	Q9NYR8	311 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TNN	Q9UQP3	1299 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AKNA	Q7Z591	1439 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF27	Q86VH2	1401 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRU	Q92729	1446 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HEATR9	A2RTY3	570 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6C74	A6NCV1	312 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ANTXRL	A6NF34	631 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C15orf62	A8K5M9	175 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT7	O43581	403 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR137B	O60478	399 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSL4	O60488	711 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH16	O75309	829 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SAP30	O75446	220 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SCGN	O76038	276 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EPO	P01588	193 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYGB	P07316	175 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT17	P0C025	328 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PNMT	P11086	282 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ODC1	P11926	461 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AZU1	P20160	251 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNNA2	P26232	953 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA13	P27216	316 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FNTA	P49354	379 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB9A	P51151	201 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT6	P53370	316 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH12	P55289	794 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R38	P59533	333 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP10-8	P60410	259 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP1B	P68106	108 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE1B	Q01064	536 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KLC1	Q07866	573 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BST1	Q10588	318 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G7	Q13093	441 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC3	Q13217	504 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MESD	Q14696	234 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CA9	Q16790	459 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HKDC1	Q2TB90	917 aa		2.55	□□□□□ -2

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