RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554207.1

PSMA3-205, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-205	ENST00000554207	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TMOD1	P28289	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	BACE1	P56817	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	USH1G	Q495M9	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207		Q6ZVQ6	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207		A0A087X002	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207		A0A1B0GUL7	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	PDXK	O00764	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	MAPK13	O15264	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	RIPK2	O43353	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	PCDH7	O60245	1069 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	HMBS	P08397	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	PSMA5	P28066	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	PTPN4	P29074	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	SOX3	P41225	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	DRP2	Q13474	957 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	LITAF	Q99732	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	GPA33	Q99795	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	AP2A2	O94973	939 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FGF19	O95750	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CA3	P07451	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	TNNI3	P19429	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	GIF	P27352	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	ADRA1A	P35348	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	NPY2R	P49146	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	FHIT	P49789	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	XG	P55808	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CSNK2B	P67870	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-205	ENST00000554207	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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