RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	PIK3CB	P42338	1070 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	RGS1	Q08116	209 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	FAM53B	Q14153	422 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MUM1	Q2TAK8	710 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ACER2	Q5QJU3	275 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	AMER3	Q8N944	861 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	KCT2	Q8NC54	265 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	REPS1	Q96D71	796 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SCMH1	Q96GD3	660 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	LRIT2	A6NDA9	550 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222		H3BQF6	201 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	FOXS1	O43638	330 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NPHS1	O60500	1241 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SERPIND1	P05546	499 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	INHBB	P09529	407 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	PCNA	P12004	261 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	DGKQ	P52824	942 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	PMPCA	Q10713	525 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	DSG2	Q14126	1118 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NDUFA9	Q16795	377 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	HHAT	Q5VTY9	493 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	BIVM	Q86UB2	503 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	GHDC	Q8N2G8	530 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NUDT8	Q8WV74	236 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MVB12A	Q96EY5	273 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	VPS50	Q96JG6	964 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MS4A8	Q9BY19	250 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	AICDA	Q9GZX7	198 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NEURL1	O76050	574 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SERPINE1	P05121	402 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SERPINB5	P36952	375 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NUP107	P57740	925 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	IFT88	Q13099	833 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	RCN2	Q14257	317 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	BTBD16	Q32M84	506 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	EMC4	Q5J8M3	183 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	FRG2	Q64ET8	278 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	RNF175	Q8N4F7	328 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MGARP	Q8TDB4	240 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	CCT6B	Q92526	530 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	NINJ1	Q92982	152 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SMIM10	Q96HG1	83 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	C18orf12	Q96KH6	178 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	FRG2B	Q96QU4	278 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQ72	361 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	URAD	A6NGE7	173 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	C4orf51	C9J302	202 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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