RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RANBP10Q6VN20 620 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FAM162AQ96A26 154 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN18Q99952 460 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GWJ7 208 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 HAX1O00165 279 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 HAS3O00219 553 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 UGDHO60701 494 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CLN5O75503 358 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 UPK1BO75841 260 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 OTCP00480 354 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MC4RP32245 332 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GPR143P51810 404 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PTTG1IPP53801 180 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM11AP58511 58 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CBFBQ13951 182 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TRAM1Q15629 374 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 VWA2Q5GFL6 755 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD13Q7L211 337 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PHF21BQ96EK2 531 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RNFT2Q96EX2 444 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SCRN2Q96FV2 425 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 DPY30Q9C005 99 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 USP54Q70EL1 1684 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LRRN3E7EW58 273 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PTGES3LE9PB15 166 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PRAMEF2O60811 474 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA2P01563 188 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 IL1AP01583 271 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CD1BP29016 333 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 RSU1Q15404 277 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NR0B2Q15466 257 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PDK4Q16654 411 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FAM153CQ494X1 144 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PNCKQ6P2M8 343 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GHDCQ8N2G8 530 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 DKKL1Q9UK85 242 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 U3KQV3 271 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SCN7AQ01118 1682 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087X0T9 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FAM234BA2RU67 622 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PIRO00625 290 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 OR4E1P0C645 316 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ACVR2AP27037 513 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CLCN7P51798 805 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 AQP5P55064 265 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 WNT3AP56704 352 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CRADDP78560 199 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB6Q15916 424 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TEX44Q53QW1 395 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CES4AQ5XG92 561 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 BEST4Q8NFU0 473 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FCGR1BQ92637 280 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MYOCQ99972 504 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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