RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC35E2P0CK97 266 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 CPMP14384 443 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 MAOAP21397 527 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN4P29074 926 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 MPIP34949 423 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 WNT3P56703 355 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC74AQ0VAA2 488 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 STX4Q12846 297 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 MLC1Q15049 377 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 PGS1Q32NB8 556 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 TREML1Q86YW5 311 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS37AQ8NEZ2 397 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 CRB3Q9BUF7 120 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3-205ENST00000528462 APC2O95996 2303 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PP18 115 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 OR2W5A6NFC9 320 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CFLARO15519 480 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PDPK1O15530 556 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP1B1P05026 303 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 HEXBP07686 556 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 UMODP07911 640 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CD1EP15812 388 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PRDX6P30041 224 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GALNSP34059 522 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 DLSTP36957 453 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 DGKQP52824 942 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 EMP2P54851 167 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 NSDHLQ15738 373 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 FGF11Q92914 225 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SCN2AQ99250 2005 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CAPN3P20807 821 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 NTSP30990 170 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 FOLR3P41439 243 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 OR4F3Q6IEY1 312 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM205Q6UW68 189 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 OR52E6Q96RD3 313 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 BBS4Q96RK4 519 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ACACAQ13085 2346 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC154A6NI56 674 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 NR5A2O00482 541 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ALOX12BO75342 701 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 F8A1P23610 371 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 STT3AP46977 705 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PLIN5Q00G26 463 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT72Q14CN4 511 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 COQ5Q5HYK3 327 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GK5Q6ZS86 529 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TSLPQ969D9 159 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS33AQ96AX1 596 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PQ72 361 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 IGHEP01854 428 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 IFI6P09912 130 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXL2P58012 376 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ID2Q02363 134 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TLR1Q15399 786 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM180BQ6P0A1 224 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.61■□□□□ 0.89
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