RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, human

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSNARE1-208	ENST00000524325	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	FKBP10	Q96AY3	582 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	NXPE2	Q96DL1	559 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MTERF3	Q96E29	417 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	BBS4	Q96RK4	519 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CRB3	Q9BUF7	120 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	PSME2	Q9UL46	239 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	UBOX5	O94941	541 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	C6orf47	O95873	294 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	C1QC	P02747	245 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	ALB	P02768	609 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IL6	P05231	212 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	UMOD	P07911	640 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	HSPB3	Q12988	150 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	DTX1	Q86Y01	620 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IL17B	Q9UHF5	180 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		21.32	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	GSN	P06396	782 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CPM	P14384	443 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CDKN2C	P42773	168 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	EMP2	P54851	167 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	HSD17B7	P56937	341 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	TLR1	Q15399	786 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	VASH2	Q86V25	355 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	C8orf44	Q96CB5	159 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		21.31	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IL10	P22301	178 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	STARD8	Q92502	1023 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	RCN3	Q96D15	328 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325		A0A1W2PP18	115 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325		A0A1W2PRB8	838 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CFLAR	O15519	480 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	TBX19	O60806	448 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IFNA16	P05015	189 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	DNASE1L3	Q13609	305 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	FBXO27	Q8NI29	283 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	KAT2A	Q92830	837 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MAGED4	Q96JG8	741 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	SERHL	Q9NQF3	203 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		21.3	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	AIM2	O14862	343 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC22A2	O15244	555 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	T-ENOL	P0DO92	83 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	HBA1	P69905	142 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	GTDC1	Q4AE62	458 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	REP15	Q6BDI9	236 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	WDR54	Q9H977	334 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	TCFL5	Q9UL49	500 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		21.29	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		21.28	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
TSNARE1-208	ENST00000524325	HRK	O00198	91 aa		21.28	■■□□□ 1

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