RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRT6CP48668 564 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 DHODHQ02127 395 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 NME3Q13232 169 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 ITPK1Q13572 414 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF528Q3MIS6 628 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 KLHL22Q53GT1 634 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 BSPRYQ5W0U4 402 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 IRGCQ6NXR0 463 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 LCLAT1Q6UWP7 414 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSKQ6UWY0 536 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 PAQR9Q6ZVX9 377 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 NR2C2APQ86WQ0 139 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 CARM1Q86X55 608 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 TBC1D10CQ8IV04 446 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC110Q8TBZ0 833 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPR148Q8TDV2 347 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM37Q8WXS4 190 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM45BQ96B21 275 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC51Q96ER9 411 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSGA13Q96PP4 275 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 FICDQ9BVA6 458 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 FUNDC2Q9BWH2 189 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 NACA2Q9H009 215 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 COG4Q9H9E3 785 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 GDF3Q9NR23 364 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 NLGN3Q9NZ94 848 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 THYN1Q9P016 225 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 LHX3Q9UBR4 397 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-390P-201ENST00000516259 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A1B0GWJ7 208 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR5H15A6NDH6 313 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRR23AA6NEV1 266 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 A8MU76 341 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARHGEF9O43307 516 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 GMNNO75496 209 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHRNA3P32297 505 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 MMP12P39900 470 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 CAMLGP49069 296 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 PGFP49763 221 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF131P52739 623 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 MYBPC1Q00872 1141 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 RBBP4Q09028 425 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPP2Q13103 211 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 LY6DQ14210 128 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 WSCD2Q2TBF2 565 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRIT3Q3SXY7 679 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 MOGAT2Q3SYC2 334 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZFP69Q49AA0 526 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 CES4AQ5XG92 561 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF613Q6PF04 617 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 Q6ZRG5 221 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 USP43Q70EL4 1123 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASRGL1Q7L266 308 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 PARP8Q8N3A8 854 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 CERS5Q8N5B7 392 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 BCORP1Q8N888 145 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 BEST4Q8NFU0 473 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF519Q8TB69 540 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCED1BQ96HM7 432 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGAP4Q96P64 663 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 ABCG4Q9H172 646 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM231Q9H6L2 316 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 C3orf14Q9HBI5 128 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 NGBQ9NPG2 151 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 SOHLH2Q9NX45 425 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 BCAP29Q9UHQ4 241 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIF3AQ9Y496 699 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 SYNJ2O15056 1496 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A0A6YYD4 124 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM89A2RUT3 159 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 RGSL1A5PLK6 1076 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 G3V2L1 256 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 STK17BO94768 372 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 HEXBP07686 556 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 LYNP07948 512 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRIM49P0CI25 452 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms