RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CLDN5O00501 218 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FZD7O75084 574 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINI2O75830 405 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PRAMEF12O95522 483 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFB10O96000 172 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 EPOP01588 193 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DRD5P21918 477 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NR2C2P49116 596 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KIF5AQ12840 1032 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KIR2DS3Q14952 304 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZMYND11Q15326 602 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SSX2Q16385 188 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC152Q4G0S7 254 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 C8orf74Q6P047 294 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KMT5CQ86Y97 462 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC43Q8N309 656 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 BANPQ8N9N5 519 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 C7orf57Q8NEG2 295 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR52K1Q8NGK4 314 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR13J1Q8NGT2 312 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR52N5Q8NH56 324 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NT5C3BQ969T7 300 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC45Q96CN5 670 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LGALS12Q96DT0 336 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MTBPQ96DY7 904 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PSKH2Q96QS6 385 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF607Q96SK3 696 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
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PDE4D-218ENST00000509368 ALG12Q9BV10 488 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM117Q9H0C3 514 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 HIF1ANQ9NWT6 349 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RAB20Q9NX57 234 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF224Q9NZL3 707 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SIX4Q9UIU6 781 aa2.05□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
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PDE4D-218ENST00000509368 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa2.05□□□□□ -2.08
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PDE4D-218ENST00000509368 TJP1Q07157 1748 aa2.05□□□□□ -2.08
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PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PNV4 684 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ERVV-2B6SEH9 535 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LGALS8O00214 317 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PRRG1O14668 218 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CACNG3O60359 315 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LRP3O75074 770 aa2.04□□□□□ -2.08
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PDE4D-218ENST00000509368 ADCY5O95622 1261 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CPNE6O95741 557 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GLUD1P00367 558 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 AGTP01019 485 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CSF2P04141 144 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 IQCF3P0C7M6 154 aa2.04□□□□□ -2.08
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PDE4D-218ENST00000509368 IL4RP24394 825 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CCKBRP32239 447 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MAP2K2P36507 400 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMPOP42166 694 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MMP13P45452 471 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GLUD2P49448 558 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CCL11P51671 97 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMPRSS3P57727 454 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KCNK10P57789 538 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 INHBEP58166 350 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ACTR3P61158 418 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GPR50Q13585 617 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GRB14Q14449 540 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SPHARQ15513 63 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MAJINQ3KP22 176 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ADPRMQ3LIE5 342 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FNBP1LQ5T0N5 605 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SLC39A4Q6P5W5 647 aa2.04□□□□□ -2.08
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PDE4D-218ENST00000509368 CENPUQ71F23 418 aa2.04□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
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