RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPV3	Q8NET8	790 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CD200R1	Q8TD46	325 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PYCR2	Q96C36	320 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSG	Q96EG1	525 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RASL10B	Q96S79	203 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SGPP1	Q9BX95	441 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL15	Q9NXU5	204 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOT	Q9UBF9	498 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC13	O75165	2243 aa		9.99	□□□□□ -0.81
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SKAP2-209	ENST00000497511	CES2	O00748	559 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HCN1	O60741	890 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNI3	P19429	210 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	AHR	P35869	848 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ2	P63252	427 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	BTN3A2	P78410	334 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CCZ1B	P86790	482 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF5A	Q12840	1032 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SP140	Q13342	867 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNMB1	Q16558	191 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	OPN5	Q6U736	354 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT6B	Q92526	530 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SCYL1	Q96KG9	808 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SGCZ	Q96LD1	299 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM5	Q9C035	493 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A088AWK7	358 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JN53	185 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCA1	A8K7I4	914 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
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SKAP2-209	ENST00000497511	SLC1A2	P43004	574 aa		9.98	□□□□□ -0.81
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SKAP2-209	ENST00000497511	HK2	P52789	917 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B7	P56937	341 aa		9.98	□□□□□ -0.81
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SKAP2-209	ENST00000497511	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01560	Q8TB33	94 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CALML6	Q8TD86	181 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ATL1	Q8WXF7	558 aa		9.98	□□□□□ -0.81
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SKAP2-209	ENST00000497511	KIRREL1	Q96J84	757 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3GL2	Q99962	352 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL31	Q9H511	634 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MED16	Q9Y2X0	877 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C1Q1	480 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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