RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PPCDCQ96CD2 204 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FCRL1Q96LA6 429 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 XKR8Q9H6D3 395 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BRF2Q9HAW0 419 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 STMN3Q9NZ72 180 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 U3KQA8 63 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PP55 124 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 H7BY64 318 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF10CO14798 259 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HPRP00739 348 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IL3P08700 152 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GPR89BP0CG08 455 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CKMT1AP12532 417 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ACP5P13686 325 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HSD3B1P14060 373 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HSD3B2P26439 372 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ACADLP28330 430 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRIM2P49643 509 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BCL7AQ4VC05 210 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BROXQ5VW32 411 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF773Q6PK81 442 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR2L2Q8NH16 312 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SAP25Q8TEE9 199 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZFP90Q8TF47 636 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 REPS1Q96D71 796 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 F2RL3Q96RI0 385 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SGPP1Q9BX95 441 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ABCG4Q9H172 646 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 REEP4Q9H6H4 257 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PQ72 361 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 H3BMQ9 156 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HAT1O14929 419 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SNPHO15079 494 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SUV39H1O43463 412 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IGHV4-34P06331 123 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CD247P20963 164 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CRYBA2P53672 197 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ISL1P61371 349 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 COPZ1P61923 177 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MPEG1Q2M385 716 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SZRD1Q7Z422 152 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C17orf64Q86WR6 236 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RNF130Q86XS8 419 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NAXDQ8IW45 347 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CADM3Q8N126 398 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 COG8Q96MW5 612 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SPRY4Q9C004 299 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LHPPQ9H008 270 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 REEP1Q9H902 201 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KCNK6Q9Y257 313 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EYSQ5T1H1 3165 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPC4 97 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C1orf226A1L170 272 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SERTM1A2A2V5 107 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.65□□□□□ -1.34
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