RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ISOC1	Q96CN7	298 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DOK1	Q99704	481 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HAUS8	Q9BT25	410 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RHBG	Q9H310	441 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL31	Q9H511	634 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PELI2	Q9HAT8	420 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FANCE	Q9HB96	536 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RLIM	Q9NVW2	624 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C5AR2	Q9P296	337 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ICK	Q9UPZ9	632 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNK6	Q9Y257	313 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ASF1A	Q9Y294	204 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MUC3A	Q02505	3323 aa		5.51	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SCN2A	Q99250	2005 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PR77	199 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC160	A6NGH7	325 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C4orf47	A7E2U8	309 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		H7BY64	318 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		J3KTA2	159 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	XPNPEP2	O43895	674 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GMNN	O75496	209 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SEC14L2	O76054	403 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FABP3	P05413	133 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SYP	P08247	313 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	THEGL	P0DJG4	465 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ARAF	P10398	606 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK4	P11802	303 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ACP5	P13686	325 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FPR1	P21462	350 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ACVR2A	P27037	513 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DCK	P27707	260 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TEAD1	P28347	426 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PKLR	P30613	574 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FMO3	P31513	532 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HPCAL1	P37235	193 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL6	P41182	706 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP2K4	P45985	399 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ITGA1	P56199	1179 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	BNC1	Q01954	994 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DMPK	Q09013	629 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RPA4	Q13156	261 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	AQP6	Q13520	282 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	VEZF1	Q14119	521 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NEDD8	Q15843	81 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HLA-B	Q31612	363 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR107	Q5VW38	600 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC80	Q76M96	950 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR141	Q7Z602	305 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF130	Q86XS8	419 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ARL10	Q8N8L6	244 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR13H1	Q8NG92	308 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		5.5	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms