RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487791.1

HBA1-204, Transcript of hemoglobin subunit alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HBA1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1-204ENST00000487791 SDHDO14521 159 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 JUNP05412 331 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SERPINA7P05543 415 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 ITGA3P26006 1051 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 MPIP34949 423 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SOX8P57073 446 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 OR4N5Q8IXE1 308 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 GALNT16Q8N428 558 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 RIT1Q92963 219 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 PPCDCQ96CD2 204 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 BBS4Q96RK4 519 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 C1orf50Q9BV19 199 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 LHPPQ9H008 270 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 REEP4Q9H6H4 257 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TAS2R7Q9NYW3 318 aa21.49■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SCN2AQ99250 2005 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 A8MUA0 341 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 C17orf105B2RV13 164 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 PRR35P0CG20 571 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 CPMP14384 443 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 EPHA3P29320 983 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 NTSP30990 170 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 CCL11P51671 97 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 ID2Q02363 134 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 EPGNQ6UW88 154 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SHISA5Q8N114 240 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 B3GNT7Q8NFL0 401 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 IMMP1LQ96LU5 166 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 ADNPQ9H2P0 1102 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 MMP25Q9NPA2 562 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 CES1P1Q9UKY3 287 aa21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 IDO1P14902 403 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 AQP5P55064 265 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SLC26A5P58743 744 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TICAM1Q8IUC6 712 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 EXTL1Q92935 676 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 VMP1Q96GC9 406 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TCF7L2Q9NQB0 619 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 GPR83Q9NYM4 423 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 HEY2Q9UBP5 337 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TUBD1Q9UJT1 453 aa21.47■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TBX19O60806 448 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SLITRK5O94991 958 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TACR1P25103 407 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 CLCN2P51788 898 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 EFNA3P52797 238 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 POLE2P56282 527 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 GALNT12Q8IXK2 581 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 STON2Q8WXE9 905 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TM9SF4Q92544 642 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 AGAP4Q96P64 663 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 ZBTB18Q99592 522 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 SLC25A23Q9BV35 468 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 DPY30Q9C005 99 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 KCNK13Q9HB14 408 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 GIMAP2Q9UG22 337 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa21.46■■□□□ 1.03
HBA1-204ENST00000487791 UBDO15205 165 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 AKAP10O43572 662 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 LRATO95237 230 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 ATP1B1P05026 303 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 G6PDP11413 515 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 NT5EP21589 574 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 PGDP52209 483 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 CLDN8P56748 225 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 STX1BP61266 288 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 MYBPC3Q14896 1274 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 GSTA3Q16772 222 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 DPY19L1Q2PZI1 675 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 CPTPQ5TA50 214 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 SLC5A8Q8N695 610 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.45■■□□□ 1.02
HBA1-204ENST00000487791 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms